138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2721 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1069    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.45 
 
 
748 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  34.6 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  30.73 
 
 
585 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  37.72 
 
 
577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  29.35 
 
 
566 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  36.84 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.99 
 
 
568 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  31.08 
 
 
551 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  30.26 
 
 
580 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  39.47 
 
 
510 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  40.26 
 
 
426 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  36.26 
 
 
360 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  28.26 
 
 
558 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.72 
 
 
499 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  36.67 
 
 
521 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.95 
 
 
535 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  39.22 
 
 
567 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  35.8 
 
 
523 aa  90.9  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  34.08 
 
 
602 aa  87  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  40.52 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.36 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  35.2 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.13 
 
 
556 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  40.97 
 
 
443 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.89 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.3 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  34.67 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.99 
 
 
580 aa  80.1  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  43.22 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  35.66 
 
 
628 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.88 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.48 
 
 
530 aa  77  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.88 
 
 
714 aa  76.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  34.09 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  42.97 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  37.66 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  33.14 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  33.14 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  37.01 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  37.01 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  33.14 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.22 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  41.51 
 
 
268 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.33 
 
 
507 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  37.01 
 
 
430 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  33.95 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  45.71 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  30.46 
 
 
464 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  33.95 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  33.95 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  34.75 
 
 
424 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  38.1 
 
 
566 aa  61.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  32.96 
 
 
519 aa  61.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  44.29 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  44.29 
 
 
581 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  44.29 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  44.29 
 
 
581 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  44.29 
 
 
578 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.29 
 
 
578 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  35.83 
 
 
586 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  35.71 
 
 
436 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  44.29 
 
 
578 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  44.29 
 
 
578 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  36.36 
 
 
505 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  31.55 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  34.69 
 
 
602 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  36.43 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  35.71 
 
 
572 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  33.86 
 
 
426 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  34.69 
 
 
557 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  35.21 
 
 
426 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  33.08 
 
 
222 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  35.05 
 
 
601 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  34.58 
 
 
508 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  34.58 
 
 
508 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  41.18 
 
 
579 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  34.58 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  34.58 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  34.58 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  34.58 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  38.64 
 
 
539 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  28.57 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  34.58 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  34.58 
 
 
516 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  34.58 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  38.57 
 
 
506 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  35.92 
 
 
526 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  35 
 
 
466 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  31.32 
 
 
475 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  31.94 
 
 
709 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  33.58 
 
 
198 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  35.05 
 
 
582 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  34.02 
 
 
571 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.23 
 
 
605 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  28.37 
 
 
256 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  40 
 
 
618 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>