More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2710 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  80.6 
 
 		 211 aa  343  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  74.65 
 
 		 231 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  75.12 
 
 		 205 aa  315  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  75.38 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 200 aa  274  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  65.33 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  66 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  65.83 
 
 		 330 aa  268  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  64 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 271 aa  261  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  60 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  62.56 
 
 		 221 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  61.06 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 317 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  244  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 207 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  58.65 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  57.28 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  57.95 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  52.28 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  30.26 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  37.61 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.78 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>