More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2675 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  764    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  39.07 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  39.07 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  39.33 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  39.07 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  39.07 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  38.82 
 
 
387 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  38.82 
 
 
387 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  39.32 
 
 
387 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  39.06 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
385 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  39.52 
 
 
381 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  38.8 
 
 
387 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  38.54 
 
 
403 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  38.54 
 
 
403 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  38.54 
 
 
403 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  37.76 
 
 
393 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  38.89 
 
 
404 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  36.23 
 
 
446 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
407 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  38.33 
 
 
406 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
386 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  41.32 
 
 
368 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  38.06 
 
 
568 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
402 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  37.14 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  34.95 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
440 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
412 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  37.56 
 
 
417 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
407 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  36.18 
 
 
565 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
422 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  35.66 
 
 
431 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
424 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.74 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.74 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.59 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.68 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 
478 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  22.13 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.51 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.29 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.18 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.3 
 
 
522 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 
444 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 
391 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  22.8 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
497 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.84 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.54 
 
 
456 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
534 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.4 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
524 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  28.48 
 
 
467 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 
518 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.7 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  21.23 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  25.97 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.65 
 
 
487 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.86 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.48 
 
 
492 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.76 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  29.94 
 
 
456 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.76 
 
 
399 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  31.58 
 
 
553 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.88 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.06 
 
 
488 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  31.58 
 
 
582 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  26.63 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
587 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.46 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
502 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  30.77 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  27.62 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 
539 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  22.55 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>