More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2642 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 592 aa  1130    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  58.36 
 
 		 522 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  56.79 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  59.58 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  58.13 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  56.08 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  57.04 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  59.35 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  59.35 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  59.35 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  52.8 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  55.04 
 
 		 508 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  53.33 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  55.88 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  55.88 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  56.01 
 
 		 510 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  52.54 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  52.27 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  52.03 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  49.55 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.52 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  58.88 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  52.6 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  54.45 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  34.69 
 
 		 568 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  35.01 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.28 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.33 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.88 
 
 		 553 aa  233  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.3 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  34.46 
 
 		 576 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.75 
 
 		 556 aa  210  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  41.22 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.22 
 
 		 610 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  34.62 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  32.5 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.29 
 
 		 562 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.83 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.68 
 
 		 573 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.37 
 
 		 1017 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.58 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.38 
 
 		 573 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.68 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.51 
 
 		 573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.98 
 
 		 573 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.43 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.7 
 
 		 588 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  30.75 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  29.02 
 
 		 603 aa  173  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  29.44 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.85 
 
 		 601 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  27.56 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.68 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  30.32 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  29.96 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  29.76 
 
 		 530 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.72 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  33.41 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  31.37 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  31.39 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  32.94 
 
 		 532 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  31.69 
 
 		 544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  32.23 
 
 		 550 aa  136  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  28.73 
 
 		 532 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  29.85 
 
 		 552 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  28.35 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  30.73 
 
 		 551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  36.39 
 
 		 551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  33.11 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  30.97 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  28.47 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  28.91 
 
 		 803 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  33.52 
 
 		 563 aa  128  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  35.61 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  27.63 
 
 		 530 aa  127  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  28.74 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  34.47 
 
 		 622 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  33.82 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  26.38 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  33.03 
 
 		 572 aa  123  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  34.4 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  34.38 
 
 		 551 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  30.16 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  31.18 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  33.06 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  33.05 
 
 		 558 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.29 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  34.75 
 
 		 630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  32.74 
 
 		 648 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  22.06 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  25.58 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  32.14 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  34.45 
 
 		 542 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  34.33 
 
 		 561 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  31.48 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  32.87 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>