250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2630 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  100 
 
 
225 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  63.84 
 
 
274 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  62.72 
 
 
249 aa  280  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  66.19 
 
 
262 aa  279  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  64.19 
 
 
250 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  62.67 
 
 
246 aa  251  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  54.13 
 
 
221 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  59.31 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  53.96 
 
 
268 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  52.47 
 
 
254 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  53.02 
 
 
243 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  53.27 
 
 
366 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  51.58 
 
 
243 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  55.88 
 
 
239 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  49.78 
 
 
246 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  52.38 
 
 
224 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  44.91 
 
 
305 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  50.72 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  41.74 
 
 
273 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  49.52 
 
 
218 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  50 
 
 
225 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  49.52 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  45.29 
 
 
243 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  44.84 
 
 
250 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  46.63 
 
 
270 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  43.61 
 
 
247 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  43.61 
 
 
247 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  43.61 
 
 
247 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  46.7 
 
 
218 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  45.45 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  45.54 
 
 
285 aa  167  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  42.86 
 
 
242 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  45 
 
 
229 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  45.89 
 
 
225 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  41.07 
 
 
270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  41.07 
 
 
270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  47.06 
 
 
270 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  47.49 
 
 
200 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  46.89 
 
 
217 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  42.16 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  42.16 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  41.62 
 
 
195 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  42.13 
 
 
219 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  42.13 
 
 
219 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  43.15 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  40.3 
 
 
235 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  34.26 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  38.16 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  40.98 
 
 
217 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  40.86 
 
 
218 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  38.83 
 
 
232 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  38.16 
 
 
216 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  39.8 
 
 
216 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  42 
 
 
208 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.99 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  33.17 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  43.11 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  30.93 
 
 
215 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  30.93 
 
 
215 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  30.93 
 
 
215 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  30.93 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.1 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.47 
 
 
215 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  35.41 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.44 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  31.95 
 
 
215 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  31.95 
 
 
215 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  33.82 
 
 
208 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  35.16 
 
 
214 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  35.89 
 
 
205 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  34.47 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.67 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  32.83 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  31.47 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  36.1 
 
 
205 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  33.49 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  32.75 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  33.53 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  35.33 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  33.98 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0117  membrane protein  30.16 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  34.47 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  28.05 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  31.18 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  32.51 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  34.66 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  33.17 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  30.92 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  32.52 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  30.54 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  30.92 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  32.02 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  32.02 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  32.02 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  30.92 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>