More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2525 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  100 
 
 		 434 aa  833    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  61.03 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  51.04 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  43.32 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  40.92 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  40.37 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  37.18 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  50 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.08 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  36.41 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  35.23 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  48.71 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.8 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.91 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.35 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  48.98 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  44.96 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.64 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  46.96 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  49.07 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  36.41 
 
 		 388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.34 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  41.12 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.06 
 
 		 395 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  44.08 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.16 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  43.02 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  37.74 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  36.92 
 
 		 463 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.44 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 445 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.78 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 624 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  44.17 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  48.79 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  34.1 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  45.18 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.46 
 
 		 431 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  34.28 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 326 aa  124  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 459 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  45.06 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 587 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  43.78 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  41.28 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 725 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  40.47 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  40.15 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  41.29 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 570 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  38.61 
 
 		 664 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  38.86 
 
 		 720 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 565 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  36.51 
 
 		 686 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 709 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  37.82 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.49 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  40.31 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 682 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>