More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2486 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  100 
 
 		 347 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  62.24 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  63.96 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.37 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.51 
 
 		 396 aa  371  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  55.33 
 
 		 363 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  56.27 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  51.63 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  51.81 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  54.49 
 
 		 389 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.3 
 
 		 1162 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  44.31 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  50.75 
 
 		 857 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 473 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.18 
 
 		 461 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.84 
 
 		 461 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.84 
 
 		 461 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.63 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.9 
 
 		 508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  40.28 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 473 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 466 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 458 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 471 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 493 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.36 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.04 
 
 		 460 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  38.01 
 
 		 354 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.37 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 640 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.68 
 
 		 467 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 310 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 487 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 470 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 468 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.03 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 504 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 639 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 493 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.86 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.86 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.46 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  36.86 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  36.86 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.18 
 
 		 512 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  36.86 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.86 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  34.78 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.86 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.5 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 459 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.03 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 463 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 359 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 639 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 482 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.48 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 639 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.72 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 723 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 641 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  28.25 
 
 		 603 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  38.91 
 
 		 594 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>