185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2416 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  100 
 
 
603 aa  1162    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  63.67 
 
 
602 aa  618  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  52.85 
 
 
714 aa  302  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.71 
 
 
530 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  35.81 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  36 
 
 
535 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.54 
 
 
558 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  36.99 
 
 
580 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  37.95 
 
 
551 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  33.91 
 
 
556 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  48.24 
 
 
628 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.89 
 
 
508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.08 
 
 
507 aa  153  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.32 
 
 
585 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  49.11 
 
 
605 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  43.52 
 
 
580 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  54.73 
 
 
584 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.66 
 
 
566 aa  144  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  30.28 
 
 
620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  34.99 
 
 
568 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.23 
 
 
748 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.71 
 
 
567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35.16 
 
 
510 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  38.61 
 
 
360 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.07 
 
 
426 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  28.76 
 
 
481 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  40.65 
 
 
222 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.53 
 
 
516 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  29.36 
 
 
589 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  36.36 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  30.7 
 
 
521 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  47.52 
 
 
480 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  47.52 
 
 
480 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  47.52 
 
 
480 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.78 
 
 
488 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  36.07 
 
 
561 aa  93.2  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.78 
 
 
511 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  28.89 
 
 
512 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.56 
 
 
443 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  35.16 
 
 
577 aa  90.9  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  29.97 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  35.82 
 
 
637 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  45.8 
 
 
535 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  29.62 
 
 
502 aa  87  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  29.97 
 
 
484 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  26.01 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  44.17 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  43.17 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  44.17 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  43.17 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  40.59 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  40.59 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.79 
 
 
310 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.63 
 
 
578 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  43.41 
 
 
578 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  47.62 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  40.62 
 
 
512 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  45.54 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  47.62 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  47.62 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.26 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  41.38 
 
 
539 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  27.91 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  46.08 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  43.69 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  33.11 
 
 
485 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45.13 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  44.12 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  31.43 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.12 
 
 
550 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  26.7 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  26.11 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  44.72 
 
 
516 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  33.33 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  32.85 
 
 
198 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  25.36 
 
 
430 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  27.83 
 
 
479 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  28.71 
 
 
441 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  25.36 
 
 
430 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  33.58 
 
 
565 aa  72  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  35.67 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  38.35 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.92 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  27.05 
 
 
408 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  24.71 
 
 
411 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  24.71 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  24.71 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  34.62 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  26.1 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.19 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  30.52 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.37 
 
 
546 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.06 
 
 
561 aa  67  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  25.87 
 
 
405 aa  67  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  24.78 
 
 
594 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  41.18 
 
 
508 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  41.18 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  25.7 
 
 
555 aa  66.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  24.27 
 
 
436 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  25.41 
 
 
475 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>