132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2351 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  100 
 
 		 427 aa  859    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  31.31 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  32.01 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  32.06 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  31.07 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  29.46 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  26.06 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  35.2 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.96 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  23.8 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.67 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.08 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.1 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.13 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.04 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.54 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.12 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.68 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.54 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.61 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.41 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.41 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.58 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.77 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.53 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.28 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  21.53 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.42 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  26.45 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.06 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.96 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  23.46 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.81 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  23.75 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.4 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  25.41 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.38 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  23.72 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  23.76 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.78 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.96 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  33.06 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  22.9 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.9 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.51 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.51 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.39 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  22.07 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.37 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.88 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.41 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  26.79 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.32 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.16 
 
 		 369 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.6 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.55 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.3 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.38 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.22 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.92 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.19 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.69 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.82 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  25.55 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  23.35 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.95 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  21.12 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  27.64 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  27.47 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  23.27 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  24.52 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 361 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  34 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  22.96 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.24 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 198 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>