187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2300 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2183  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 
616 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.5 
 
 
723 aa  778    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21480  ribonucleoside-triphosphate reductase class III catalytic subunit  51.54 
 
 
754 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2300  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  100 
 
 
765 aa  1586    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.99 
 
 
708 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.1 
 
 
747 aa  781    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1116  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.61 
 
 
733 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.287436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0138  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.95 
 
 
738 aa  734    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.450422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1539  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.48 
 
 
736 aa  694    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.854468  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1942  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.64 
 
 
734 aa  777    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1929  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.36 
 
 
802 aa  705    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1125  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  45.78 
 
 
805 aa  705    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2640  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.48 
 
 
616 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1317  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.84 
 
 
744 aa  704    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2694  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.48 
 
 
616 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.4 
 
 
712 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.4 
 
 
712 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.4 
 
 
712 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  632  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  632  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  46.27 
 
 
712 aa  632  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  631  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  632  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46 
 
 
712 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46 
 
 
712 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.27 
 
 
712 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46 
 
 
712 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3748  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.75 
 
 
712 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2834  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.91 
 
 
705 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2441  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.91 
 
 
705 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2511  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.05 
 
 
705 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1650  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.78 
 
 
705 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1687  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.78 
 
 
705 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.673685  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.33 
 
 
712 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.64 
 
 
705 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837695  hitchhiker  0.000803625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2603  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.91 
 
 
705 aa  618  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.33 
 
 
712 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1665  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.64 
 
 
705 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.33 
 
 
712 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.54 
 
 
712 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1540  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.5 
 
 
705 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0437  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.97 
 
 
712 aa  612  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0525  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.26 
 
 
712 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.77 
 
 
706 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.91 
 
 
712 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0791  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.48 
 
 
706 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1275  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.05 
 
 
705 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1600  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.78 
 
 
705 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2619  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.5 
 
 
705 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0417  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.05 
 
 
712 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.5 
 
 
705 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  normal  0.0662102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.61 
 
 
705 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.83 
 
 
704 aa  595  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.04 
 
 
705 aa  594  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05713  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.69 
 
 
706 aa  595  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000107  ribonucleotide reductase of class III (anaerobic) large subunit  43.55 
 
 
706 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.98 
 
 
704 aa  568  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.06 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1001  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.51 
 
 
706 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  34.45 
 
 
704 aa  391  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02440  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.84 
 
 
740 aa  381  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.187193  normal  0.336585 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04760  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.94 
 
 
737 aa  382  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.496041  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.2 
 
 
740 aa  375  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  31.06 
 
 
736 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.52 
 
 
676 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.61 
 
 
670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2571  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.94 
 
 
775 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.37 
 
 
705 aa  291  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.37 
 
 
705 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.71 
 
 
746 aa  289  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.3 
 
 
789 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.5 
 
 
759 aa  280  9e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.24 
 
 
618 aa  272  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000577057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3614  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.24 
 
 
618 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.58287e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2252  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.5 
 
 
618 aa  272  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00612019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3398  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.24 
 
 
618 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3310  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.09 
 
 
618 aa  271  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3663  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.24 
 
 
618 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0424871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1604  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.73 
 
 
618 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379053  hitchhiker  0.000000212198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0702  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.4 
 
 
769 aa  267  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000299094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.94 
 
 
618 aa  267  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3711  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.19 
 
 
619 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0130664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.56 
 
 
619 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00561072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.88 
 
 
618 aa  265  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.09 
 
 
798 aa  243  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3590  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.13 
 
 
720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  30.84 
 
 
1197 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.25 
 
 
692 aa  155  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.48 
 
 
705 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.19 
 
 
695 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.6 
 
 
710 aa  132  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.36 
 
 
791 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.44 
 
 
791 aa  127  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.68 
 
 
791 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.93 
 
 
686 aa  124  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.4 
 
 
813 aa  122  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.34 
 
 
669 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.35 
 
 
681 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>