More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2297 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
542 aa  1008    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  51.43 
 
 
227 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 
352 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 
307 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
292 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  42.78 
 
 
229 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.46 
 
 
251 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
199 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
238 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.37 
 
 
373 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 
503 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 
522 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  43.96 
 
 
353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 
275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  39.33 
 
 
417 aa  141  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 
320 aa  140  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  41.9 
 
 
242 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  37.76 
 
 
275 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  44.89 
 
 
267 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.72 
 
 
468 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 
276 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  41.62 
 
 
262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  46.07 
 
 
248 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
264 aa  137  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
275 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
275 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
275 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
275 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
275 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 
305 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  42.37 
 
 
287 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
244 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 
413 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  36.24 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
537 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
275 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.12 
 
 
440 aa  133  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
368 aa  133  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 
263 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 
212 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
522 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  42.94 
 
 
247 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  37.85 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  41.81 
 
 
273 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 
465 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 
258 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
217 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
263 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 
258 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.59 
 
 
373 aa  127  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
324 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 
244 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  40.84 
 
 
242 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
258 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  39.55 
 
 
520 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  37.43 
 
 
271 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.41 
 
 
279 aa  123  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  43.08 
 
 
259 aa  123  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  42.71 
 
 
1120 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.38 
 
 
1115 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
215 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 
405 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.38 
 
 
927 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.38 
 
 
1115 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  41.45 
 
 
1124 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
245 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
321 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.38 
 
 
1119 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 
404 aa  121  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
372 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 
256 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
259 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.91 
 
 
267 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.38 
 
 
1115 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
197 aa  120  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.7 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 
284 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 
871 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.46 
 
 
250 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 
246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 
299 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  42.77 
 
 
289 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
275 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
273 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
285 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>