More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2273 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  77.63 
 
 		 234 aa  329  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  74.21 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  68.04 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  67.58 
 
 		 252 aa  274  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  59.29 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  58.53 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  57.73 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  57.46 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  52.16 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  55.66 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  49.36 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  61.14 
 
 		 276 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  60.73 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  55.31 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  51.25 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  54.82 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  53.22 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  58.55 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  58.64 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  55.9 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  57.41 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  58.33 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  58.42 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  56.82 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  58.42 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  58.42 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  54.09 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  59.59 
 
 		 270 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  52.78 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  56.99 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  54.21 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  59.19 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  58.11 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  58.82 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  54.95 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  53.14 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  44.75 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  47.62 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  44.6 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.74 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.25 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.93 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.28 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.59 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  45.54 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.15 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.98 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.4 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.46 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  46.05 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.24 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.86 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  40.43 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.58 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.45 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  44.65 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  44.78 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.13 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.13 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.59 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  44.39 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  43.11 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.53 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.9 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  44.5 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.37 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  44 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.67 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.67 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  43.41 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  43.41 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  43.41 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  43.41 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.86 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  41.2 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  43.5 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  42.41 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  47.09 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.13 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.16 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  42.79 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  44.5 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.79 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  40.74 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  42.92 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  44.23 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.79 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  38.86 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.04 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.95 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  40.17 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.75 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  42.47 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  42.51 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  42.38 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.59 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.59 
 
 		 383 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.81 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>