More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2232 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  55.46 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  54.84 
 
 		 247 aa  235  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  54.63 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  54.5 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  51.53 
 
 		 261 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  51.35 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  53.05 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  54.69 
 
 		 223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  49.02 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  52.85 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  49.22 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  47.47 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  43.78 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  43.28 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  42.79 
 
 		 216 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  42.79 
 
 		 216 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  40.27 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  42.29 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  42.29 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  42.29 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  42.29 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  42.29 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  42.79 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  42.29 
 
 		 216 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  43.24 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  43.24 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  40.31 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  40.31 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  42.16 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  39.59 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  41.33 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  41.58 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  39.69 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  46.36 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  40.51 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  40.31 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  39.68 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  45.22 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  40 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  37.76 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  37.76 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  38.14 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  38.42 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  37.89 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  37.89 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  37.25 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  37.76 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  37.76 
 
 		 226 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  41.1 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  34.39 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  37.04 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  37.72 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  30.23 
 
 		 388 aa  62  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.43 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.48 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.89 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  27.13 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2496  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.89 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0199  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  33.96 
 
 		 667 aa  56.2  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  32.35 
 
 		 718 aa  55.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  30 
 
 		 745 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  30.21 
 
 		 577 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.85 
 
 		 749 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1588  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.85 
 
 		 753 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.870499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.77 
 
 		 736 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.08 
 
 		 717 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  30.47 
 
 		 341 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  31.29 
 
 		 366 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1202  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.19 
 
 		 734 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.39 
 
 		 740 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  27.62 
 
 		 747 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  30.21 
 
 		 714 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.33 
 
 		 751 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1193  RelA/SpoT family protein  34.26 
 
 		 735 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000349735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.33 
 
 		 750 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  27.27 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1778  GTP pyrophosphokinase  34.51 
 
 		 707 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0230346  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0409  guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase  34.51 
 
 		 707 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0259018  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  29.69 
 
 		 714 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1049  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.26 
 
 		 756 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0253  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.17 
 
 		 753 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34378  normal  0.702738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4115  GTP pyrophosphokinase  27.13 
 
 		 737 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1408  RelA/SpoT family protein  27.83 
 
 		 731 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  27.14 
 
 		 744 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  30.56 
 
 		 739 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000545051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  30.71 
 
 		 738 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.79 
 
 		 747 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3185  GTP diphosphokinase  31.78 
 
 		 722 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0453  RelA/SpoT family protein  27.83 
 
 		 723 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000671385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>