More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2187 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  81.7 
 
 
153 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  79.74 
 
 
150 aa  245  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  77.12 
 
 
150 aa  220  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  71.9 
 
 
151 aa  216  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  65.79 
 
 
173 aa  206  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  67.53 
 
 
159 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  66.44 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  65.13 
 
 
155 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  62.58 
 
 
177 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  62.58 
 
 
177 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  62.58 
 
 
177 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  65.77 
 
 
157 aa  190  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  64.43 
 
 
157 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  61.29 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  63.69 
 
 
164 aa  187  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  61.29 
 
 
184 aa  187  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  64.05 
 
 
153 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  62.91 
 
 
183 aa  184  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  60.76 
 
 
156 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  63.87 
 
 
182 aa  180  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  59.48 
 
 
186 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  61.88 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  60.39 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  60.9 
 
 
156 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  62.91 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  58.82 
 
 
182 aa  171  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  58.82 
 
 
167 aa  170  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  58.23 
 
 
157 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  62.09 
 
 
179 aa  167  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  58.28 
 
 
149 aa  167  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  57.59 
 
 
170 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  57.96 
 
 
188 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  57.24 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  57.89 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  55.41 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  54.61 
 
 
166 aa  158  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.67 
 
 
157 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  47 
 
 
446 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
157 aa  87  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  43.26 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.64 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.71 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.5 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  43.52 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  38.57 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.65 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.7 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  39.09 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.7 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.12 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  40.52 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  41.18 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.07 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44.23 
 
 
301 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  33.11 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.76 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  41.44 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  38.39 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.05 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  37.27 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  37.27 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.31 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  32.52 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  32.09 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  35.29 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.42 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  36.11 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.83 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  34.53 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  32.59 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  37.7 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  34.09 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  41.05 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  34.58 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  31.17 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  36.11 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  37.72 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  37.24 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  37.24 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  34.31 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  42.71 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>