More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2168 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 333 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  56.71 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  53.45 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  52.81 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  49.35 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  46.65 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  48.39 
 
 		 288 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  43.33 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  47.4 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  40.72 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  45.64 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  36.62 
 
 		 314 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  43.38 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  45.39 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  43.62 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  41.25 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  41.59 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.32 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  43.34 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.77 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  42.71 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.03 
 
 		 514 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.09 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.43 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.78 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  35.18 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.02 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.38 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.02 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.69 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.75 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.15 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.96 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  30.55 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  40.24 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  32.71 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  32.01 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.71 
 
 		 322 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.62 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  34.16 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  30.54 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.23 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.67 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  27.19 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  28.37 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.76 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  30.75 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.73 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.23 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.59 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  30.43 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.16 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  31.92 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 292 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  24.62 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  23.75 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.77 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>