More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2143 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  80.25 
 
 		 162 aa  261  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  80.25 
 
 		 162 aa  258  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  80.25 
 
 		 162 aa  254  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  78.4 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  71.88 
 
 		 162 aa  223  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  66.46 
 
 		 162 aa  216  7.999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  62.66 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  61.96 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  61.25 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  61.64 
 
 		 185 aa  196  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  58.13 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.09 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  52.2 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  52.2 
 
 		 180 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  51.57 
 
 		 188 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  50.63 
 
 		 183 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  49.06 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  53.12 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  48.73 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  47.8 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  51.25 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  49.69 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.25 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  49.38 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  47.5 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  47.17 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.91 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.05 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  46.99 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  49.03 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  52.26 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  48.1 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.6 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  50 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  45.56 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  47.85 
 
 		 182 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  46.15 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  49.38 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.04 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  45.68 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.98 
 
 		 230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  42.04 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  51.37 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  42.86 
 
 		 230 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  44.05 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  43.1 
 
 		 221 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  42.94 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  44.52 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  45.68 
 
 		 197 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.9 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.63 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.38 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.76 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  44.64 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  41.28 
 
 		 213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  39.02 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  41.03 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  37.93 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  39.63 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.17 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  39.13 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.46 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  42.5 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.04 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  41.03 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.58 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  36.81 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.59 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.86 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.88 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.16 
 
 		 177 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  33.33 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  40.38 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.93 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.37 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.93 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.15 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.2 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.37 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  43.56 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  41.06 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  38.36 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.24 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  38.52 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>