266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2073 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  100 
 
 
451 aa  898    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  34.92 
 
 
422 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  40.77 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  36.58 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  32.93 
 
 
395 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  37.67 
 
 
383 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  35.64 
 
 
361 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  38.54 
 
 
367 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  35.67 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  29.51 
 
 
398 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  35.67 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  34.42 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  33.46 
 
 
391 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  34.17 
 
 
370 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  29.68 
 
 
407 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  32.13 
 
 
433 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  33.22 
 
 
390 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.52 
 
 
380 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  30.23 
 
 
399 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  30.33 
 
 
368 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.64 
 
 
394 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.01 
 
 
395 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2060  hypothetical protein  61.43 
 
 
115 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.43 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  30.23 
 
 
402 aa  86.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.51 
 
 
389 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  27.15 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.29 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  26.09 
 
 
509 aa  83.2  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  25.52 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.77 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  27.21 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  28.36 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.39 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  27.4 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.26 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  29.02 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  28.38 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.74 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.24 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.56 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  24.74 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  29.08 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.5 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  27.71 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.67 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.52 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.97 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.28 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  27.74 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.08 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.54 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  28.33 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.63 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.3 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.03 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.87 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.33 
 
 
433 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.24 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.5 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.46 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  22.73 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.59 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.76 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.69 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.39 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.75 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.1 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.81 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.21 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.21 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.51 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.18 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.85 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.27 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.27 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.05 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.35 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
386 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  23.08 
 
 
498 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  29.05 
 
 
292 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.03 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.8 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  52.46 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1799  hypothetical protein  28.26 
 
 
206 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.22 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.04 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
184 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.15 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.93 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  36.21 
 
 
198 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.66 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.81 
 
 
276 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  21.97 
 
 
381 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.05 
 
 
356 aa  60.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.51 
 
 
386 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.31 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>