33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2007 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  270  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  59.42 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  69.77 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  57.46 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  48.09 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  49.17 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  50 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  48.41 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  47.5 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  42.15 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  44.54 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  36.78 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 220 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>