More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1943 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
619 aa  1205    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  57.84 
 
 
743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  52.29 
 
 
787 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  57.14 
 
 
657 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  54.41 
 
 
680 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  47.21 
 
 
744 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  51.84 
 
 
656 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  55.17 
 
 
788 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  55.06 
 
 
682 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  54.69 
 
 
653 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  53.88 
 
 
639 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  49.22 
 
 
656 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  54.12 
 
 
689 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  48.24 
 
 
665 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  52.65 
 
 
652 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  51.43 
 
 
634 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  47.79 
 
 
725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
1085 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  50.95 
 
 
671 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  48.99 
 
 
697 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  50.94 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  51.33 
 
 
687 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.93 
 
 
662 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  45.7 
 
 
478 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  46.71 
 
 
445 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  45.55 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  42.91 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  47.39 
 
 
1193 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  42.18 
 
 
450 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  43.87 
 
 
749 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.34 
 
 
466 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  42.97 
 
 
448 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  37.98 
 
 
434 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  43.31 
 
 
441 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  42.57 
 
 
432 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  43.19 
 
 
478 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.59 
 
 
646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 
450 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 
442 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  45.14 
 
 
448 aa  193  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  45.66 
 
 
697 aa  193  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  43.51 
 
 
459 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  44.07 
 
 
622 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  42.73 
 
 
725 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  41.57 
 
 
678 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  36.84 
 
 
299 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.58 
 
 
569 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.89 
 
 
305 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35 
 
 
352 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.5 
 
 
578 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  31.09 
 
 
570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.93 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  52.38 
 
 
134 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.55 
 
 
580 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.6 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  27.6 
 
 
570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.6 
 
 
570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.61 
 
 
617 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
228 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 
443 aa  111  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  35.92 
 
 
425 aa  107  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.24 
 
 
336 aa  103  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  34.83 
 
 
477 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  33.59 
 
 
328 aa  101  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  33.64 
 
 
405 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.86 
 
 
419 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
493 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.69 
 
 
332 aa  97.4  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.95 
 
 
428 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 
391 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  34.8 
 
 
468 aa  94.4  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  34.25 
 
 
416 aa  94  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.35 
 
 
451 aa  93.6  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  33.79 
 
 
393 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.11 
 
 
326 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.32 
 
 
322 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  39.26 
 
 
328 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  41.04 
 
 
775 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  30.12 
 
 
327 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  36.08 
 
 
335 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 
328 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  34.26 
 
 
795 aa  91.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.71 
 
 
332 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  34.55 
 
 
639 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  33.82 
 
 
771 aa  90.9  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.96 
 
 
773 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  34.68 
 
 
328 aa  90.9  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  33.96 
 
 
773 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  36.53 
 
 
771 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.99 
 
 
459 aa  90.5  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.37 
 
 
400 aa  90.5  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  34.87 
 
 
330 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.64 
 
 
781 aa  89.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 
327 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 
327 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.22 
 
 
325 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  32.57 
 
 
789 aa  87.8  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.81 
 
 
335 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 
781 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>