117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1908 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  33.82 
 
 
277 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  32.65 
 
 
308 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  34 
 
 
296 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  34.74 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  36.68 
 
 
322 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  34.94 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  30.8 
 
 
363 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  32.59 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  33.9 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  25.26 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  32.62 
 
 
293 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  32.37 
 
 
292 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  37.96 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.85 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  37.09 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  23.91 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  32.51 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  31.09 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  30.84 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  25.27 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.11 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  37.21 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  29.54 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  35.46 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.35 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  34.64 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.61 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  21.43 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  32.87 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  33.72 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  34.29 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
368 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.33 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  29.78 
 
 
326 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
320 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  29.5 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  26.35 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  36 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  23.76 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.92 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  26.7 
 
 
585 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  33.77 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  33.77 
 
 
288 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
289 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  34.86 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05175  alpha/beta hydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07060)  30.63 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0627526  normal  0.0627844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  29.53 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  38.82 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  37.65 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  35.07 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.2 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  30.86 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  22.73 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  32.14 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>