233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1793 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
215 aa  417  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  57.35 
 
 
231 aa  197  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  46.48 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  48 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  47.34 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  42.71 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.83 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  47.92 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  38.54 
 
 
211 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  54 
 
 
213 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  44 
 
 
211 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.67 
 
 
211 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.3 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  42.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  42.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  42.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.33 
 
 
211 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.67 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  36 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  36 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  36 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  42.67 
 
 
211 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  39.09 
 
 
214 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.2 
 
 
208 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  49.09 
 
 
232 aa  147  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.73 
 
 
207 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  50 
 
 
206 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  51.32 
 
 
212 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  44.62 
 
 
222 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  44.06 
 
 
206 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.51 
 
 
233 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  49.3 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  44.32 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  46.41 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.85 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  40.1 
 
 
218 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  49.05 
 
 
233 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  39.13 
 
 
213 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.71 
 
 
210 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.32 
 
 
211 aa  138  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  47.49 
 
 
213 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  43.09 
 
 
200 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.65 
 
 
219 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  34.63 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  51.7 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  41.55 
 
 
199 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  49.68 
 
 
209 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  42.56 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  44.75 
 
 
245 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  44 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  44.44 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  46.86 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  46.29 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  43.33 
 
 
290 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  35.56 
 
 
212 aa  124  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  39.9 
 
 
204 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  46.95 
 
 
195 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38.69 
 
 
203 aa  122  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  34.78 
 
 
203 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  34.78 
 
 
203 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  34.78 
 
 
203 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  46.05 
 
 
209 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  41.57 
 
 
195 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  38.58 
 
 
204 aa  121  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  36.82 
 
 
204 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.3 
 
 
201 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  51.01 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  46.29 
 
 
196 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.46 
 
 
195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35.58 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.45 
 
 
195 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.45 
 
 
195 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.45 
 
 
195 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.75 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  38.81 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  40.3 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  38.81 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  52.35 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  35.47 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.65 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.51 
 
 
196 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40.51 
 
 
196 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  39.9 
 
 
212 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  41.15 
 
 
303 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  41.15 
 
 
303 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.68 
 
 
203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  42.75 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.2 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.68 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  37.13 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  32.5 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  43.02 
 
 
303 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  42.47 
 
 
204 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>