121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1700 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
472 aa  917    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 
467 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  46.02 
 
 
467 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
440 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  43.5 
 
 
440 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 
468 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  40.14 
 
 
449 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  37.82 
 
 
449 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  38.26 
 
 
443 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  35.12 
 
 
435 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  36.64 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  36.64 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  36.64 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  38.19 
 
 
445 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.15 
 
 
460 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  32.36 
 
 
435 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  34.19 
 
 
426 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
451 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  32.53 
 
 
463 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  31.64 
 
 
429 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
465 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  30.85 
 
 
455 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  31.77 
 
 
469 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
462 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.4 
 
 
443 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.01 
 
 
462 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.42 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  31.81 
 
 
424 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.92 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  28.03 
 
 
440 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  30.42 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  31.89 
 
 
467 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  30.66 
 
 
424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  29.95 
 
 
463 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  28.54 
 
 
493 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  29.13 
 
 
454 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  30.3 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  29.07 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  29.18 
 
 
460 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  28.77 
 
 
460 aa  136  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  30.54 
 
 
456 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.33 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  27.94 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
426 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
421 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.46 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.08 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  27.55 
 
 
492 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.46 
 
 
427 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  26.08 
 
 
427 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.08 
 
 
427 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.95 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.95 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.99 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.95 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.52 
 
 
440 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  27.16 
 
 
416 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  26.45 
 
 
408 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.46 
 
 
427 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  24.28 
 
 
458 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
442 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  28.02 
 
 
453 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26 
 
 
474 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  26.73 
 
 
430 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  28.31 
 
 
456 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  28.89 
 
 
462 aa  104  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  28.31 
 
 
456 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26 
 
 
460 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24.22 
 
 
447 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.11 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.8 
 
 
446 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
444 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
572 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.5 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  24.41 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  25.17 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  27.4 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26.81 
 
 
436 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
430 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.62 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  28.78 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>