More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1674 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 390 aa  773    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  67.44 
 
 		 371 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  61.04 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  59.11 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  57.18 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  56.62 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  56.62 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  59.9 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  56.62 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  56.22 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  55.56 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  56.61 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  58.16 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  52.34 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  53.45 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  56.74 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  53.33 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  52.32 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  50.48 
 
 		 408 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  51.04 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  54.43 
 
 		 352 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  50.39 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  50.52 
 
 		 353 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  50 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  48.35 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  48.35 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  48.21 
 
 		 359 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  52.08 
 
 		 358 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  47.27 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  47.55 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  50.13 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  45.41 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  48.26 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  46.02 
 
 		 366 aa  262  8.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  38.93 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  46.63 
 
 		 350 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  40.77 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  40.48 
 
 		 365 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  39.36 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  41.67 
 
 		 314 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  40.46 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  38.77 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  38.59 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  36.04 
 
 		 341 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  40.29 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  39.88 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  39.88 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  32.7 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  35.49 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  35.21 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.17 
 
 		 495 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  31.55 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.82 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  31.83 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.43 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.46 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.48 
 
 		 603 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.79 
 
 		 861 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.1 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  31.32 
 
 		 520 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  31.32 
 
 		 520 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  31.32 
 
 		 520 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  31.82 
 
 		 877 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  29.41 
 
 		 871 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.22 
 
 		 522 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  28.91 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  25.82 
 
 		 316 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  30.48 
 
 		 320 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.09 
 
 		 815 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  32.27 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  32.5 
 
 		 657 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.97 
 
 		 902 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  32.53 
 
 		 513 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  34.17 
 
 		 816 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  32.94 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.53 
 
 		 797 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  30.36 
 
 		 867 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  32.26 
 
 		 321 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 312 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  31.74 
 
 		 831 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  33.47 
 
 		 825 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.91 
 
 		 316 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  24.92 
 
 		 307 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  29.04 
 
 		 646 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  24.87 
 
 		 813 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.96 
 
 		 847 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  32.34 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  30.71 
 
 		 863 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  31.42 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  25.65 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  31.9 
 
 		 513 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  30.82 
 
 		 872 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  26.62 
 
 		 896 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  32.16 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  33.46 
 
 		 845 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  29.32 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  30.71 
 
 		 763 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  35.06 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>