60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1606 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 		 476 aa  936    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  49.42 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  52.75 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.93 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.57 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.57 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.57 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.57 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.45 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.15 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.44 
 
 		 233 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.98 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.14 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  29.24 
 
 		 188 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.93 
 
 		 197 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  37.06 
 
 		 205 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.78 
 
 		 220 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.76 
 
 		 205 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  28.14 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.59 
 
 		 205 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  31.79 
 
 		 196 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.76 
 
 		 181 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.76 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.39 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  31.71 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.43 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.29 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  34.71 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.14 
 
 		 198 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.93 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  32.6 
 
 		 224 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.55 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  32.6 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.55 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  32.6 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  32.6 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  32.6 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  32.6 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.97 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.4 
 
 		 211 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.19 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  31.95 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  31.95 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.18 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  29.34 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  28.14 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.34 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.83 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  26.46 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.35 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  23.46 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  28.83 
 
 		 645 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  23.58 
 
 		 169 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.57 
 
 		 114 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>