51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1552 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  72.73 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  69.07 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  69 
 
 
98 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  64.36 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  61.62 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  64.65 
 
 
113 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  62.38 
 
 
123 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  64.21 
 
 
115 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  62.5 
 
 
118 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  63.16 
 
 
111 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  55.88 
 
 
123 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  62.11 
 
 
113 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  60 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  57.14 
 
 
119 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  58.16 
 
 
115 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  55.56 
 
 
117 aa  110  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  61.9 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  63.75 
 
 
99 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  55.1 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  51.06 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  57.45 
 
 
114 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  47.52 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  46.15 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  38 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  38.71 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  43.01 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  37.63 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  39.8 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  37.63 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  36 
 
 
114 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  38 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  39.18 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  39.18 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  39.78 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  39.78 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  41.24 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  36.25 
 
 
127 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  40.86 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  38.04 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  34.69 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  37.23 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  34.69 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  40.26 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  39.18 
 
 
114 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  37.11 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  31.17 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>