More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1474 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  77.73 
 
 		 445 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  72.56 
 
 		 441 aa  634    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  100 
 
 		 438 aa  869    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  75.98 
 
 		 442 aa  628  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  66.67 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  65.07 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  66.43 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  63.74 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  63.22 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  61.86 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  62.12 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  59.68 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  59.63 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  62.56 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  58.85 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  59 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  59.91 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  57.97 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  58.08 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  59.39 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  58.2 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  57.08 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  57.51 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  58.29 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  56.78 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  58.39 
 
 		 444 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  57.18 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.01 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  54.65 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  55.94 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  53.2 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  54.21 
 
 		 444 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  55.76 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  51.49 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  50.93 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  48.98 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  49.19 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  51.52 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  46.06 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  46.95 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.04 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  32.43 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  32.84 
 
 		 473 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.25 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  31.31 
 
 		 485 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.21 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  31.77 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  30.88 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  32.01 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.24 
 
 		 497 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  31.14 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.66 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  30.08 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  30.92 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.71 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.21 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  26.61 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  30.45 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.2 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  27.34 
 
 		 549 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.89 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.57 
 
 		 507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.57 
 
 		 507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.82 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  28.03 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.22 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.06 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.78 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  27.13 
 
 		 490 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.13 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.06 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.74 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  28.77 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.74 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  25.13 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.64 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.73 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.45 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  23.13 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  29.76 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  26.38 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  26.33 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26.12 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  23.9 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.64 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.2 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  23.11 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  31.1 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.82 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.18 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.29 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.23 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  23.6 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>