More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1421 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  100 
 
 
431 aa  859    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  74.51 
 
 
404 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  67.55 
 
 
404 aa  567  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  70.74 
 
 
409 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  67.69 
 
 
409 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  62.98 
 
 
397 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  64.18 
 
 
404 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  62.74 
 
 
401 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  60.58 
 
 
398 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  58.88 
 
 
416 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  63.48 
 
 
396 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  61.72 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  59.52 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  59.47 
 
 
396 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  53.96 
 
 
387 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  54.39 
 
 
382 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  56.17 
 
 
384 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  54.74 
 
 
382 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  54.74 
 
 
382 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  54.26 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  52.63 
 
 
387 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  54.29 
 
 
398 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  54.44 
 
 
386 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  53.81 
 
 
386 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  54.44 
 
 
395 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  52.93 
 
 
411 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  52.06 
 
 
387 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  52.25 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  43.97 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  45.95 
 
 
404 aa  336  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  43.97 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  40.19 
 
 
388 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
536 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
390 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.15 
 
 
418 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
413 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
446 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
373 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
391 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
417 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
413 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
410 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
391 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.18 
 
 
420 aa  103  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
396 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
394 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
375 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
398 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
458 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
450 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
419 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
396 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.94 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
415 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.29 
 
 
443 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
482 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
346 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.53 
 
 
650 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.7 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
353 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.69 
 
 
395 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
405 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
419 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28.6 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.08 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
395 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
748 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
498 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
409 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.64 
 
 
427 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>