169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1400 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  76.08 
 
 
217 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  76.08 
 
 
217 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  76.56 
 
 
214 aa  327  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  75.6 
 
 
217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.06 
 
 
221 aa  270  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  63.64 
 
 
205 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  54.81 
 
 
208 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.78 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.48 
 
 
200 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.89 
 
 
204 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  45.21 
 
 
204 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  42.29 
 
 
228 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 
204 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  42.93 
 
 
215 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  45.2 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.9 
 
 
217 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.63 
 
 
221 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.95 
 
 
212 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.5 
 
 
221 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  41.41 
 
 
218 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.33 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  42.46 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.9 
 
 
209 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.22 
 
 
219 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  42.33 
 
 
205 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.71 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  39.06 
 
 
198 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.56 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.22 
 
 
201 aa  118  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.43 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  40.76 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  40.61 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
200 aa  104  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.25 
 
 
204 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.8 
 
 
197 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.55 
 
 
200 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
224 aa  98.2  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.96 
 
 
179 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.68 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.18 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
180 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.11 
 
 
196 aa  94.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.73 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.73 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  37.27 
 
 
181 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
192 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.18 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.06 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  35.35 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.9 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.76 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  34.83 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.25 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.31 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  33.14 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.27 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.93 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.38 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  37.19 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.51 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.58 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.93 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.45 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  30.82 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.56 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.67 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
177 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.38 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.83 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.11 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.56 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>