146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1304 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  547  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  50.19 
 
 
266 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  41.91 
 
 
281 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  42.97 
 
 
278 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  46.3 
 
 
279 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  44.49 
 
 
274 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  34.73 
 
 
265 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  34.35 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  43.59 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  43.59 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  43.59 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  32.73 
 
 
275 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.64 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  33.19 
 
 
271 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  34.47 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  32.31 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  38.66 
 
 
279 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  30.94 
 
 
293 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  30.94 
 
 
293 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.18 
 
 
284 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  33.49 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  30.49 
 
 
284 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.41 
 
 
278 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  34.15 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30.49 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  34.2 
 
 
274 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  28.26 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.07 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  28.26 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  28.26 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  28.26 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  28.38 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  34.5 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  30.92 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  28.31 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  25.96 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  30.17 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.19 
 
 
290 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  30.8 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 
287 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  32.05 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  34.32 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  30.95 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  31.37 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  31.75 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  28.47 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  28.67 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  28.87 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.79 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  30.58 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.44 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  29.52 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  24.02 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.56 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25.56 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  28.23 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  28.69 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  28.19 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  32.4 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.27 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  26.04 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.35 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  29.51 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  29.13 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  30.74 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.02 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  30.52 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.22 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.95 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  32.87 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  27.09 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.47 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.17 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  27.38 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  29.66 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  27.65 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  25.63 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  32.17 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  36.59 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27.31 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  34.86 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  26.94 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  25.87 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  30.14 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  32.7 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  32.73 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  30.73 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  28.89 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  24.5 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  22.45 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  32.52 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>