More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1163 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  87.61 
 
 		 113 aa  199  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  89.19 
 
 		 112 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  82.88 
 
 		 112 aa  186  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  80.18 
 
 		 112 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  70.27 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  72.07 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  71.17 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  69.37 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  63.96 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  65.77 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  64.86 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  74.77 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  72.07 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.66 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  64.6 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  53.15 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  67.57 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.95 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  54.05 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.95 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.86 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  54.05 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  54.95 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>