202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1055 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  100 
 
 		 507 aa  1036    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  70.3 
 
 		 529 aa  690    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  67.21 
 
 		 474 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  63.15 
 
 		 483 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  63.64 
 
 		 483 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  64.52 
 
 		 463 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.35 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  63.71 
 
 		 503 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  65.99 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  60.64 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.43 
 
 		 485 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  60.08 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  64.24 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  46.29 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  48.36 
 
 		 447 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  49.17 
 
 		 437 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  42.56 
 
 		 527 aa  339  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.88 
 
 		 433 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.83 
 
 		 539 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  43.48 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  36.6 
 
 		 650 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  42.75 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  42.75 
 
 		 535 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 247 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 292 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 246 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 246 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 238 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 265 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 256 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 		 254 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 246 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 246 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 255 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 293 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 261 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.69 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 240 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 253 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.36 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.61 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 326 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2338 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  31.52 
 
 		 318 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 289 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 		 268 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 247 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2287 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 254 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  35.48 
 
 		 2273 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  35.48 
 
 		 2137 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 264 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 266 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  35.48 
 
 		 2258 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 291 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  36.84 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.46 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 268 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 246 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 267 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 266 aa  47.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 293 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 255 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 254 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 286 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 252 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 249 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 262 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.17 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  35.16 
 
 		 2294 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 262 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>