56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0872 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  746    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  34.12 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.74 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.22 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.43 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.16 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  39.36 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  33.33 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1120  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  28.72 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.67 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4871  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 517 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  24.77 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 470 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  24.77 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>