222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0795 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0795  integrase family protein  100 
 
 		 401 aa  801    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  51.75 
 
 		 422 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  36.83 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  34.91 
 
 		 384 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  33.25 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  33.08 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  33.08 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  31.25 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  28.5 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  30.83 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1936  phage integrase family protein  40 
 
 		 194 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0331565  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1401  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0749  phage integrase family protein  39.16 
 
 		 182 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5647  integrase family protein  27.42 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.37 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.6 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.61 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.61 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.3 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.22 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.35 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.22 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.86 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.94 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  26.48 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.48 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.6 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.9 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.6 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.5 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.92 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.12 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.48 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.92 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.79 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  25.34 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.05 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.16 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.22 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.34 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.14 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.86 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.53 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  30.35 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.93 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.1 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  26.06 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.58 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.04 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  21.43 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.09 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.36 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  26.13 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.35 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.68 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.61 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.24 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.61 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.24 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.8 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.8 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  23.68 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.48 
 
 		 329 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  25.16 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3374  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.68 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  23.1 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0801  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 326 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  24.39 
 
 		 506 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.92 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.79 
 
 		 431 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.56 
 
 		 251 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  25.32 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  21.9 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  25.52 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  19.89 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  26.34 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.68 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.77 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  28.85 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>