More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0607 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  100 
 
 
413 aa  786    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 
411 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  38.38 
 
 
397 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
442 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 
508 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  44.29 
 
 
430 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  36.52 
 
 
433 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
412 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  35.04 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  45.28 
 
 
339 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  35.38 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.8 
 
 
387 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  39.44 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  44.73 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  33.84 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  38.35 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  40.47 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  41 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  43.83 
 
 
401 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  37.94 
 
 
402 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  34.01 
 
 
403 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  39.8 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
458 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  39.59 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  37.14 
 
 
432 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  37.33 
 
 
643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
406 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  39.06 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  41.94 
 
 
433 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
372 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  36.55 
 
 
456 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
485 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.62 
 
 
830 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  30.72 
 
 
422 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  34.71 
 
 
413 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
682 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
775 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
352 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.27 
 
 
338 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  35.89 
 
 
664 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
478 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.65 
 
 
388 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  34.4 
 
 
529 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  38.12 
 
 
2361 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
552 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
440 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.61 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
682 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
464 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  29.82 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
638 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
351 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
425 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.61 
 
 
466 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
459 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.61 
 
 
466 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
351 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
459 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
466 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
466 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
466 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
799 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  36.62 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
552 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.38 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.79 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  27.51 
 
 
351 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.29 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  37.18 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  27.51 
 
 
351 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  35.15 
 
 
308 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  31.71 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  30.58 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  34.22 
 
 
620 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  35 
 
 
799 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  35.5 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.59 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
632 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  37.07 
 
 
470 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
564 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
748 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.91 
 
 
598 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.3 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>