173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0604 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
326 aa  656    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.02 
 
 
245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
254 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.53 
 
 
187 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  44.75 
 
 
279 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.2 
 
 
270 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  43.09 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.77 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  38.86 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5894  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  40.83 
 
 
381 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.74 
 
 
247 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0972  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0942  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 
635 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  48.28 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.18 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.7 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.13 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  43.24 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  41.33 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 
143 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  49.12 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.44 
 
 
163 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0600  enhanced entry protein  29.3 
 
 
175 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  48.57 
 
 
225 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1554  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.3 
 
 
175 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.93 
 
 
575 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  51.79 
 
 
228 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  41.75 
 
 
462 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  37.18 
 
 
259 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.44 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  37.07 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 
395 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.11 
 
 
160 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  35.09 
 
 
519 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  43.48 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  38.46 
 
 
406 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  29.86 
 
 
229 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 
398 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 
398 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  49.15 
 
 
234 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 
398 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  45.21 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.93 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  35.09 
 
 
496 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.43 
 
 
382 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.51 
 
 
544 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  42.11 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.02 
 
 
309 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.09 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  34.21 
 
 
520 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.59 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  42.47 
 
 
204 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  49.15 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  35.71 
 
 
455 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34 
 
 
2272 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.18 
 
 
257 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.98 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  49.18 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.95 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  46.55 
 
 
383 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.43 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  47.46 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.57 
 
 
232 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  45.28 
 
 
409 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  47.46 
 
 
762 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.54 
 
 
508 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
549 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  47.46 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.64 
 
 
531 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 
846 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  44.26 
 
 
292 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.71 
 
 
433 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  39.56 
 
 
454 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  40.35 
 
 
392 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.84 
 
 
266 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  41.38 
 
 
396 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  37.36 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  35.54 
 
 
248 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  35.54 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1337  hypothetical protein  34.23 
 
 
157 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.03 
 
 
160 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  41.94 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 
665 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  49.15 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>