More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0466 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  100 
 
 
447 aa  859    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  67.75 
 
 
441 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  60.28 
 
 
469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  64.46 
 
 
475 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  61.43 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  61.59 
 
 
433 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  51.42 
 
 
415 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  52.01 
 
 
409 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  51.18 
 
 
412 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  52.42 
 
 
424 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  50.99 
 
 
413 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  50.12 
 
 
407 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  46.17 
 
 
462 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  48.54 
 
 
449 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  48.72 
 
 
465 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  48.4 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  42.32 
 
 
435 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  50.55 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.12 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.22 
 
 
460 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  46.39 
 
 
395 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.52 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.27 
 
 
464 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.64 
 
 
464 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.64 
 
 
464 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 
464 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 
464 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 
464 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.56 
 
 
477 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 
464 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.52 
 
 
464 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 
464 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.14 
 
 
476 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.14 
 
 
476 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  42.18 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.41 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.45 
 
 
464 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  36.79 
 
 
482 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  41.04 
 
 
399 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  33.01 
 
 
461 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  41.04 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  44.11 
 
 
401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.52 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  35.62 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  40.67 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  35.43 
 
 
399 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  35.62 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  34.77 
 
 
398 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  41.04 
 
 
399 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  35.62 
 
 
399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  40.67 
 
 
399 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  40.67 
 
 
399 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.23 
 
 
484 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.23 
 
 
484 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.13 
 
 
476 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.99 
 
 
492 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  37.59 
 
 
398 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  34.27 
 
 
495 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  34.85 
 
 
485 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  39.34 
 
 
403 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  38.89 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  38.24 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  38.73 
 
 
484 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.7 
 
 
467 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.59 
 
 
425 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  46.4 
 
 
414 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  39.94 
 
 
376 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.82 
 
 
481 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  40.86 
 
 
397 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.27 
 
 
391 aa  159  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.42 
 
 
469 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  44.79 
 
 
368 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.21 
 
 
395 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  43.19 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  28.77 
 
 
456 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.87 
 
 
554 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.6 
 
 
451 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  36.09 
 
 
391 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  36.09 
 
 
391 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  45.96 
 
 
377 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  35.93 
 
 
383 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  32.84 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.18 
 
 
455 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.32 
 
 
445 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  33.98 
 
 
395 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.08 
 
 
451 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.33 
 
 
402 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  36.27 
 
 
391 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  42.58 
 
 
393 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  36.75 
 
 
391 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  36.51 
 
 
407 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  29.23 
 
 
506 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  36.75 
 
 
391 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  35.93 
 
 
391 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  36.75 
 
 
391 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.43 
 
 
486 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.07 
 
 
391 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  34.72 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>