201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0413 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  52.63 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  60.75 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  53.1 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  51.85 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  51.75 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  45.87 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  48.62 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  47.17 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  49.54 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  43.93 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  50.96 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  44.66 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  46.73 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  53.25 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  34.82 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  34.48 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  28.44 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  32.74 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  32.74 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  31.86 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  32.22 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.03 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  30.67 
 
 		 240 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>