63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0353 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  100 
 
 
135 aa  272  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  41.73 
 
 
144 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  38.58 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  42.97 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.62 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.62 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  40.62 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.64 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  41.41 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  41.41 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  44.62 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.28 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  38.4 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.06 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  39.53 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.37 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  34.11 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.94 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.25 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  43.21 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  33.07 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.13 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.13 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.13 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  36.29 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  32.28 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  34.13 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  31.9 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  34.88 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.54 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  29.55 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  30.47 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  26.98 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.36 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.5 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  27.94 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  32.22 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.45 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.95 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.69 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0864  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.81 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  28.06 
 
 
223 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1372  hypothetical protein  22.14 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.823726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.82 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.27 
 
 
225 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  25.38 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1328  hypothetical protein  21.74 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3876  hypothetical protein  35.37 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.45 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  30.34 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  36.26 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.29 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2284  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.21 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0160  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.11 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>