190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0277 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  100 
 
 
714 aa  1373    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  52.79 
 
 
602 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  57.03 
 
 
603 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.89 
 
 
584 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.8 
 
 
628 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  35.5 
 
 
558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  37.44 
 
 
580 aa  195  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  34.03 
 
 
580 aa  195  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  33.47 
 
 
499 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  52.3 
 
 
530 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  35.99 
 
 
535 aa  167  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  45.61 
 
 
605 aa  143  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.41 
 
 
585 aa  140  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  51.97 
 
 
551 aa  129  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  42.86 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.8 
 
 
748 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  31.55 
 
 
566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.53 
 
 
568 aa  111  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  40.37 
 
 
507 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  38.5 
 
 
508 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  38.73 
 
 
620 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  33.8 
 
 
637 aa  103  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  44.19 
 
 
360 aa  102  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  42.66 
 
 
521 aa  98.6  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  34.87 
 
 
567 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  37.25 
 
 
426 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  35.86 
 
 
443 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  40.14 
 
 
222 aa  97.1  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  37.76 
 
 
502 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  50.55 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  39.74 
 
 
523 aa  96.3  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  50.55 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  50.55 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  34.85 
 
 
443 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.52 
 
 
510 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  37.27 
 
 
512 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  37.27 
 
 
516 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  45.45 
 
 
535 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  38.89 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  48.35 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  39.68 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  46.32 
 
 
524 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  46.32 
 
 
519 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  45.65 
 
 
546 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  40.91 
 
 
511 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  40.91 
 
 
488 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  42.48 
 
 
581 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  42.48 
 
 
581 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  46.15 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.23 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  46.15 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  42.48 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  42.48 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  42.48 
 
 
578 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  48.91 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  46.74 
 
 
550 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  37.58 
 
 
442 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  27.93 
 
 
481 aa  77  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  41.59 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  40.54 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  40.54 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  45.26 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  41.23 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  35.88 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  44.09 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.61 
 
 
546 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.31 
 
 
561 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  44.25 
 
 
516 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  32.39 
 
 
553 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  39.67 
 
 
441 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  34.9 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.03 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  35.03 
 
 
567 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  45.05 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  44.57 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  38.26 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  42.39 
 
 
550 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  36.04 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  43.48 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  43.48 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  43.48 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  43.48 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.08 
 
 
743 aa  67.4  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  43.48 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  43.48 
 
 
491 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  43.48 
 
 
491 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  43.48 
 
 
491 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  43.48 
 
 
516 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  30.34 
 
 
169 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  32.59 
 
 
198 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  36.36 
 
 
434 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.01 
 
 
519 aa  65.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  50.82 
 
 
504 aa  64.7  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  34.42 
 
 
404 aa  65.1  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  32.22 
 
 
411 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  43.04 
 
 
620 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  40 
 
 
709 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  32.22 
 
 
377 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  32.22 
 
 
377 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  32.88 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>