More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0248 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 470 aa  891    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1464  putative signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 486 aa  199  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 621 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  38.84 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  40.67 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  35.44 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.47 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  33.33 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  35.78 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.78 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.78 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  33.01 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  33.49 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  38.69 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 725 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  33.65 
 
 		 580 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.92 
 
 		 410 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 594 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  35.98 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  33.65 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 375 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  33.02 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  31.67 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  34.3 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  33.5 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  33.04 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  38.28 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  31.9 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.93 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  33.05 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  32.3 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.93 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  37.5 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  28.77 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  38.73 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  28.98 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.29 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 1226 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  34.72 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  26.09 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  32.7 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  34.67 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 1229 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 1101 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 709 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.96 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  33.49 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.82 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.97 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.86 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  36.53 
 
 		 687 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  35.75 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  30.05 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.16 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  28.1 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  28.93 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.14 
 
 		 587 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>