74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0090 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0090  asparagine synthase  100 
 
 		 633 aa  1245    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3327  asparagine synthase  32.25 
 
 		 599 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14520  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.8 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1145  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.64 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2986  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  27.93 
 
 		 611 aa  90.5  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.524565  normal  0.15701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.93 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6316  asparagine synthase  28.1 
 
 		 609 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.79 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0183361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.7 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.24 
 
 		 678 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.72 
 
 		 655 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  28.11 
 
 		 642 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.11 
 
 		 651 aa  55.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4243  asparagine synthase  28.03 
 
 		 630 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.32 
 
 		 656 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.32 
 
 		 656 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.02 
 
 		 628 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4486  asparagine synthase  25.06 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.73 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33380  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.6 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.505962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.09 
 
 		 625 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.91 
 
 		 656 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  19.95 
 
 		 623 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2064  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.68 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  26.44 
 
 		 624 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.81 
 
 		 639 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.96 
 
 		 655 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  30.89 
 
 		 643 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4186  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.706084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.4 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.87 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.77 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.2 
 
 		 655 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.83 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.58 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.41 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.59 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25 
 
 		 655 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2044  asparagine synthase  24.87 
 
 		 558 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3677  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.16 
 
 		 632 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 		 657 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  28.69 
 
 		 492 aa  47.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2780  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.54 
 
 		 646 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2520  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.12 
 
 		 620 aa  47.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0134172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.09 
 
 		 629 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.71 
 
 		 654 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.94 
 
 		 660 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.85 
 
 		 628 aa  47.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  25.13 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.07 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2683  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.92 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  23.55 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2812  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.49 
 
 		 614 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303301  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.91 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.18 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.8 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.73 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3021  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.32 
 
 		 576 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.1 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.55 
 
 		 633 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.09 
 
 		 629 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1965  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.34 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.27 
 
 		 631 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3428  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.49 
 
 		 575 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.161683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.7 
 
 		 635 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.74 
 
 		 613 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.22 
 
 		 615 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  28.06 
 
 		 610 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.3 
 
 		 882 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2103  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.03 
 
 		 351 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.14 
 
 		 613 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.52 
 
 		 590 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>