23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0085 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  45.98 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  48.42 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  46.81 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  43.4 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  46.74 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.48 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2417  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 115 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 123 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.89 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  31.87 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  32.77 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>