64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0084 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 722 aa  1355    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.57 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.22 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.85 
 
 		 415 aa  144  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.73 
 
 		 449 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.62 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.33 
 
 		 386 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.81 
 
 		 396 aa  134  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.66 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.92 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  43.94 
 
 		 442 aa  120  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  52.34 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  47.66 
 
 		 669 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  50.39 
 
 		 669 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.79 
 
 		 579 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  43.18 
 
 		 348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.51 
 
 		 350 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.19 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  45.8 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.61 
 
 		 334 aa  103  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.55 
 
 		 368 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.39 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  40.62 
 
 		 368 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40.94 
 
 		 404 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.77 
 
 		 358 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.62 
 
 		 495 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  38.06 
 
 		 447 aa  80.1  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.68 
 
 		 1000 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  43.24 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.33 
 
 		 245 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.52 
 
 		 232 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.62 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  37.78 
 
 		 196 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.33 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.13 
 
 		 2313 aa  64.3  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.38 
 
 		 830 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  35.07 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.59 
 
 		 261 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  31.33 
 
 		 3333 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  35.77 
 
 		 582 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  32.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  39.51 
 
 		 489 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 3521 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  37.5 
 
 		 551 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  40.24 
 
 		 778 aa  50.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  53.57 
 
 		 1281 aa  50.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  36.56 
 
 		 1567 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33.83 
 
 		 484 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.47 
 
 		 3486 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.97 
 
 		 3409 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 846 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  33.33 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  37.01 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  33.88 
 
 		 504 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  39.86 
 
 		 590 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  36.11 
 
 		 818 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  35.8 
 
 		 489 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.45 
 
 		 599 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  36.89 
 
 		 755 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  40.79 
 
 		 411 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  49.28 
 
 		 671 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  34 
 
 		 268 aa  43.9  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>