225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0083 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
304 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  64.68 
 
 
256 aa  328  5e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  62.06 
 
 
254 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  65.73 
 
 
252 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  67.07 
 
 
251 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  62.8 
 
 
255 aa  314  1e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  61.9 
 
 
252 aa  307  1e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  66.13 
 
 
255 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  61.75 
 
 
254 aa  304  1e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  65.46 
 
 
257 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  61.6 
 
 
254 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  63.6 
 
 
254 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  63.6 
 
 
254 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  63.6 
 
 
254 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  63.75 
 
 
256 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  62.25 
 
 
250 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  59.92 
 
 
252 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  62.5 
 
 
251 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  61.45 
 
 
255 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  61.51 
 
 
252 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  58.2 
 
 
258 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  58 
 
 
254 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  60.89 
 
 
255 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  55.82 
 
 
254 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 
255 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  52.4 
 
 
254 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 
253 aa  265  9e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  57.43 
 
 
301 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.73 
 
 
253 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  55.6 
 
 
254 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 
257 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  56.75 
 
 
252 aa  258  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 
258 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  57.83 
 
 
249 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  54.15 
 
 
255 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 
256 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  51.2 
 
 
256 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 
256 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  57.43 
 
 
252 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 
257 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  52 
 
 
255 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  51.2 
 
 
254 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  45.1 
 
 
255 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 
249 aa  246  5e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  45.1 
 
 
255 aa  245  5e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  44.71 
 
 
255 aa  245  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 
254 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
256 aa  244  1e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 
274 aa  243  2e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 
255 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
256 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  55.16 
 
 
256 aa  239  3e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 
255 aa  239  3e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
257 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 
258 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
254 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 
264 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 
299 aa  235  5e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
249 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 
255 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 
250 aa  233  4e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 
255 aa  232  7e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  51.38 
 
 
260 aa  231  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.53 
 
 
255 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  51.41 
 
 
260 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 
250 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
250 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 
273 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  46.8 
 
 
252 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  46.56 
 
 
270 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
253 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  53.06 
 
 
250 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 
262 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 
251 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 
261 aa  226  5e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  46 
 
 
252 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 
253 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.77 
 
 
253 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
250 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
255 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
256 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  43.31 
 
 
275 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  47.2 
 
 
252 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  45.6 
 
 
252 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  51 
 
 
260 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
250 aa  222  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
254 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 
254 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  46 
 
 
252 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 
250 aa  221  1e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 
250 aa  221  1e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  221  2e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  221  2e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  221  2e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  221  2e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  46 
 
 
252 aa  220  2e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
254 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>