36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0075 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0075  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  58.97 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  58.97 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  45.61 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  30.7 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  58.97 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  51.16 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  56.41 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  50 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  46.67 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  55 
 
 
83 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  55.26 
 
 
84 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  55.26 
 
 
84 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  33.93 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  43.33 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  57.89 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  53.85 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  61.11 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  55.26 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  53.85 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  30.97 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  30.97 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  51.22 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  53.85 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  51.35 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  52.5 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  58.82 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  55.26 
 
 
79 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  42.11 
 
 
87 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  52.94 
 
 
95 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  46.15 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  55.88 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  58.82 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>