79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0070 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
134 aa  258  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  64.13 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  60.71 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  58.14 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.81 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  38.14 
 
 
202 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.19 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.06 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  40.28 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  46.3 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  34.52 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  36.92 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  32.39 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  42.59 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  40.74 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  40.74 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
197 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.76 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.11 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  33.72 
 
 
162 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  30.23 
 
 
141 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.58 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  30.59 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  27.52 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  38.89 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.51 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  30.23 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  39.66 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  27.59 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  44.44 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.66 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  39.66 
 
 
231 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  37.04 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  28.24 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  28.21 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  37.04 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  29.07 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  29.07 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  29.07 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  38.71 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  28.43 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  37.04 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  37.14 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.19 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  42.55 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.53 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  37.04 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  37.04 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  37.04 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  37.04 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  37.04 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  28.57 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
138 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.48 
 
 
104 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  31.25 
 
 
132 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  32.76 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.95 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.07 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  25.23 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  25.44 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  37.04 
 
 
154 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>