More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0062 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  76.24 
 
 		 554 aa  762    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 553 aa  1109    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  65 
 
 		 580 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  61.91 
 
 		 544 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  62.57 
 
 		 542 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  58.23 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  60.33 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  56.59 
 
 		 549 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  54.77 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.19 
 
 		 544 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  53.75 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.4 
 
 		 567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.21 
 
 		 507 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 566 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.89 
 
 		 555 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.38 
 
 		 545 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.56 
 
 		 561 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  54.4 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.55 
 
 		 522 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.28 
 
 		 538 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  49.1 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  47.83 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  50.7 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.2 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  50 
 
 		 576 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.7 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  52.4 
 
 		 538 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.75 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  52.64 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  48.35 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.85 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  44.35 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  46.33 
 
 		 605 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  46.99 
 
 		 563 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  52.84 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  51.19 
 
 		 532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47.5 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.3 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  45.89 
 
 		 572 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  48.02 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  47.33 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  49.64 
 
 		 565 aa  465  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  48.7 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 		 561 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  43.12 
 
 		 593 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  47.52 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.81 
 
 		 587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  48.52 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  47.93 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.19 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.52 
 
 		 640 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47.39 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.37 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  47.86 
 
 		 560 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  47.79 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  52.19 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.68 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.86 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.68 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  46.49 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.36 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  43.56 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.85 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.37 
 
 		 532 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.48 
 
 		 553 aa  330  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.3 
 
 		 540 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.95 
 
 		 536 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 		 543 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.88 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.63 
 
 		 539 aa  316  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.56 
 
 		 529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  39.43 
 
 		 533 aa  314  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 		 541 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  36.07 
 
 		 543 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.97 
 
 		 538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 		 541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.45 
 
 		 555 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  35.98 
 
 		 568 aa  302  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 545 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 549 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.2 
 
 		 515 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  40.26 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  36.33 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 538 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  35.77 
 
 		 564 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 518 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.51 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  36.65 
 
 		 550 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 550 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  36.1 
 
 		 550 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  36.95 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.94 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  35.52 
 
 		 548 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  35.27 
 
 		 544 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  40.34 
 
 		 528 aa  286  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>