288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0058 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  100 
 
 
271 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  59.93 
 
 
272 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  47.83 
 
 
247 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  49.01 
 
 
257 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  42.48 
 
 
274 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  39.02 
 
 
268 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  38.28 
 
 
256 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  37.15 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  36.36 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  36.76 
 
 
249 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  36.76 
 
 
249 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  36.76 
 
 
249 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  38.13 
 
 
253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 
248 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  35.57 
 
 
249 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 
253 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  36.36 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.82 
 
 
259 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  35.97 
 
 
249 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  36.08 
 
 
254 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 
249 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 
247 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  34.87 
 
 
253 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  34.78 
 
 
249 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  37.94 
 
 
257 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  39.09 
 
 
254 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 
251 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 
270 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.46 
 
 
269 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 
263 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
270 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
264 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.18 
 
 
267 aa  131  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
266 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 
268 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
269 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
272 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31.17 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
269 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  36.06 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 
286 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
281 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
271 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.37 
 
 
257 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.88 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.73 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
279 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.66 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 
266 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.55 
 
 
284 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.36 
 
 
269 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.14 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 
274 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
278 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
285 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 
272 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
269 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  32.71 
 
 
289 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  32.87 
 
 
280 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
254 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 
277 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 
285 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
280 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
284 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  29.11 
 
 
265 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
318 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.64 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>