177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0052 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 470 aa  940    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  92.4 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  83.97 
 
 		 412 aa  283  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  45.64 
 
 		 508 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  50.34 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  44.9 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  45.18 
 
 		 496 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  44.9 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  44.9 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  49.66 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  49.03 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  49.66 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  49.66 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  49.03 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  49.66 
 
 		 472 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  44.21 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  38.7 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  44.86 
 
 		 275 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  46.95 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  46.34 
 
 		 440 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  48.32 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  40.88 
 
 		 308 aa  147  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  44.79 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  46.31 
 
 		 249 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  40.31 
 
 		 253 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  45.88 
 
 		 260 aa  140  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  39.29 
 
 		 253 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  39.29 
 
 		 253 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  33.83 
 
 		 789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  35.71 
 
 		 842 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  35.18 
 
 		 787 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  37.11 
 
 		 600 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  34.91 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  32.7 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  36.16 
 
 		 272 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  34.55 
 
 		 268 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.68 
 
 		 335 aa  93.6  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  29.55 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  32.16 
 
 		 319 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  32.28 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  34 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30.57 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  32.24 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  33.73 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  37.06 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  30.25 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  26.81 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  30 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  31.45 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  31.58 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  30.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  30.38 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  32.89 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  28.48 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  28.3 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  28 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  26.85 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  31.85 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  31.4 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  29.87 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  28.76 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  26.5 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  29.28 
 
 		 248 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.76 
 
 		 268 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  29.28 
 
 		 248 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  30.57 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  30.46 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  29 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  27.71 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  31.2 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  33.07 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  29.22 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  26.38 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  28.97 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  30.14 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  33.07 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  29.49 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  32.5 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  29.19 
 
 		 246 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  30.72 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  29.37 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  27.92 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  26.32 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  25.79 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  26.09 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>