More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0048 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  321  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  72.18 
 
 
145 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 
153 aa  179  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  69.91 
 
 
151 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 
156 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  59.54 
 
 
132 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 
147 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
138 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  49.63 
 
 
130 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  43.04 
 
 
170 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
291 aa  97.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  50 
 
 
144 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
153 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
124 aa  94.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
200 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
128 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  48.76 
 
 
570 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  45.32 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.57 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.54 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
267 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.77 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.35 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  34.11 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.76 
 
 
384 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
126 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.26 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  29.05 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  33.64 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.76 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  36.11 
 
 
400 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  31.9 
 
 
384 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.69 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.09 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  31.58 
 
 
139 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
244 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
138 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  35.29 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
132 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
133 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  33.08 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.68 
 
 
360 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.04 
 
 
347 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
130 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
130 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  30.77 
 
 
132 aa  61.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
139 aa  60.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.09 
 
 
133 aa  60.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  32.54 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.04 
 
 
129 aa  60.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.06 
 
 
318 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
334 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  34.38 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.34 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  53.73 
 
 
320 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.39 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.39 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  34.86 
 
 
352 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  38.81 
 
 
325 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  32.06 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  32.06 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.34 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.38 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.26 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.26 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.84 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>